咨询热线

18017847121

当前位置:首页   >  AG亚游官网平台中心  >  实验  >  测序  >  miRNA测序

  • AG亚游

miRNA测序

简要描述:miRNA测序:利用测序分析软件,通过小RNA测序可以快速鉴定物种全谱的小RNA组,并预测新的miRNA,同时可对miRNA的靶基因进行预测和功能分析。

  • 更新时间:2022-12-22
  • 浏览次数:981

详细介绍

miRNA测序服务介绍

microRNA(miRNA)是一种大小约21—23个碱基的单链小分子RNA,是由具有发夹结构的约70-90个碱基大小的单链RNA前体经过Dicer酶加工后生成,不同于siRNA(双链)但是和siRNA密切相关。microRNA通过和靶基因mRNA碱基配对引导沉默复合体(RISC)降解mRNA或抑制mRNA的翻译,从而在转录后水平调控蛋白表达(新发现miRNA也能在转录水平调控基因表达)。miRNA在物种进化中相当保守,在动物、植物和**等中发现的miRNA表达均有严格的组织特异性和时序性。miRNA在细胞生长和发育过程中起多种作用,包括调控发育、分化、凋亡和增殖等。

目前研究miRNA的方法主要是realtime-PCR、生物芯片技术以及第二代测序技术。基于第二代测序技术的miRNA测序,可以一次获得数百万条miRNA序列,能够快速鉴定出不同组织、不同发育阶段、不同**状态下已知和未知的miRNA及其表达差异,为研究miRNA对细胞进程的作用及其生物学影响提供了有力工具。

miRNA测序分析项目

标准分析项目

1) 原始数据质控(去接头污染,去低质量reads),数据产出统计;

2) 与参考序列比对;

3) 小RNA与rRNA、tRNA、snRNA、snoRNA、piRNA的比对信息;

4) 小RNA与miRBase中某范围的已知的 miRNA的比对;

5) 按照优先级将小RNA进行分类注释;

6) 预测新的miRNA;

7) 差异miRNA分析;

8) 差异miRNA表达聚类分析;

9) miRNA靶基因预测分析

10) 靶基因功能富集分析

 

上等分析项目(以下分析选择分析结果较好的3~5个)

靶基因蛋白互作网络分析

miRNA功能协同网络分析

miRNA通路协同网络分析

miRNA共调控网络分析

miRNA活性分析

按照客户要求对兴趣miRNA进行深入分析;

重要miRNA的功能富集分析;

 

样本要求

RNA样品总量: ≥3μg

RNA样品浓度: ≥200 ng/μL

 

项目周期

45个工作日

AG亚游官网平台咨询

留言框

  • AG亚游官网平台:

  • 您的单位:

  • 您的姓名:

  • 联系电话:

  • 常用邮箱:

  • 省份:

  • 详细地址:

  • 补充说明:

  • 验证码:

    请输入计算结果(填写阿拉伯数字),如:三加四=7
上海达为科生物科技(AG亚游)登录入口
  • 联系人:张
  • 地址:上海市长江南路180号长江软件园B区B637室
  • 邮箱:2844970554@qq.com
  • 传真:
关注AG亚游平台

欢迎您关注AG亚游平台的微信公众号了解更多信息

扫一扫
关注AG亚游平台
版权所有©2024上海达为科生物科技(AG亚游)登录入口All Rights Reserved    备案号:沪ICP备25408295号-2    sitemap.xml    总流量:105021
管理登陆    技术支持:化工仪器网